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アプリケーションよりコピーテーブルを参照可能な場合には、本問題は発生していません。

本問題は、同期時刻にサーバーPCを再起動すると必ず発生する訳ではありません。同期処理で実際のコピーテーブルを一時テーブルで置き換えるタイミングでサーバーPCが再起動された場合にのみ発生します。

運用環境でアプリケーションよりコピーテーブルが参照できなくなっている場合、本問題が発生している可能性があります。
問題発生時には、同期処理の際に生成される一時テーブルがデータベース上に残り、データベースが肥大化する可能性があります。